1. 사실관계

○ 개인 김◯◯과 장◯◯(이하 “신청인”이라 한다)은 2006. 2월 △△시 △△구 △△동 소재 건물을 임차하여 공동(지분율 50 : 50)으로 면세사업(이하 “A사업”이라 함)을 운영하던 중 ○○시 ○○구 ○○동 소재 건물을 임차하여 또 다른 면세사업(이하 “B사업”이라 함)을 공동으로 운영

○ 신청인은 A사업의 건물이 협소하여 신축․이전할 목적으로 2009.5.7. □□시 □□구 □□동 소재 대지를 신청인 명의로 취득하여 건물을 신축하면서 면세사업자인 A사업 명의로 건물 신축 공사계약을 체결하고 관련 세금계산서를 발급받아 매입세액을 공제받지 않고 건물 신축공사 진행

○ 신청인은 신축건물이 준공되기 전에 A사업과 B사업을 각각 독립적으로 구분하여 운영하는 방안을 검토하면서 신축 중인 건물은 신청인이 김◯◯에게 임대하기로 하고

- 부동산 임대업 시작 전인 2010. 12월에 신청인 명의로 부동산임대업에 대해 공동사업자 사업자등록

  * 김◯◯과 장◯◯의 지분율은 각각 50%씩 귀속

○ 2011.3.1. 장◯◯과 김◯◯이 각각 어느 사업을 운영할 것인지 합의하여 2011. 7월 A사업은 김◯◯, B사업은 장◯◯의 개별 사업으로 사업자등록 정정신고

○ 신청인은 건물이 준공되어 2011.8.30. A사업의 대표 김◯◯과 부동산임대차계약을 체결(보증금 0, 월 임대료 106백만원 부가세 별도)

○ 건물 신축 관련 매입세금계산서 수취 현황

- 면세사업자인 A사업 명의(2009.3.17. ∼ 2011.8.25.)

  63매, 공급가액 14,628백만원, 매입세액 1,463백만원 ⇒ 불공제

- 과세사업자인 신청인 명의(2011.8.30. ∼ 10.30.)

  4건, 공급가액 785백만원, 매입세액 78백만원 ⇒ 공제

2. 신청내용

○ 개인 두 사람이 서로 다른 두 개의 사업장을 임차하여 면세사업을 공동으로 영위하다가 그 중 한 사업장을 확장․이전하기 위해 토지를 취득하여 건물을 신축하던 중 면세사업을 공동사업자 구성원이 각각 독립적으로 구분하여 운영하고 새로이 취득한 부동산은 그 소유자인 두 사람이 당초 공동사업자 구성원인 한 사람에게 사용하도록 임대하는 경우에 있어

① 공동사업으로 영위하던 기존의 면세 사업자등록번호로 발급받은 건물 신축 관련 세금계산서 매입세액을「부가가치세법」제17조 제6항에 따라 공제할 수 있는지 여부

② 면세 사업자등록번호로 발급받은 건물의 신축에 관련된 세금계산서의 매입세액 전액을 공제할 수 있는지 아니면 공동사업자 구성원 중 한 사람의 지분 관련 매입세액만 공제할 수 있는지 여부

③ 「부가가치세법」제5조제1항 단서에 따라 부동산 임대업을 시작하기 전에 사업자등록을 한 경우 같은 법 제17조제6항에 따른 매입세액공제 과세기간이 사업자등록을 한 날이 속하는 과세기간인지 또는 부동산 임대업을 시작하는 날이 속하는 과세기간인지 여부

3. 관련법령

○ 부가가치세법 제17조 【납부세액】

○ 부가가치세법 시행령 제63조 【면세사업용 감가상각자산의 과세사업용 전환시 공제되는 매입세액의 계산】

○ 부가가치세법 제5조 【등록】

○ 부가가치세법 시행규칙 제3조 【개업일의 기준】

○ 민법 제703조 【조합의 의의】