1. 처분의 경위

가. 주식회사 aa푸드시스템(이하 ‘이 사건 회사’라고 한다)은 2012. 10. 19. aa시

aa면 aaa길 aa에서 개업하여 2014. 6. 27. 폐업한 식료품 제조업체로서, 2013년

및 2014년 부가가치세를 17,534,170원을 체납하였다.

나. 피고는 2014. 7. 16. 원고가 이 사건 회사의 주식 100%를 보유하여 구 국세기본

법(2014. 12. 23. 법률 제12848호로 개정되기 전의 것, 이하 같다) 제39조 제2호의 과점주주에 해당한다고 보아, 원고를 이 사건 회사의 제2차 납세의무자로 지정하고 원고에게 위 체납세액에 가산금을 더하여 2013년 부가가치세 5,282,430원, 9,234,030원 및 2014년 부가가치세 4,449,720원 합계 18,966,180원을 부과·고지하였다(이하 ‘이 사건 처분’이라 한다).

다. 원고는 이에 불복하여 2014. 12. 22. 국세청장에게 국세심사를 청구하였으나,

2015. 3. 16. 기각되었다.

[인정 근거] 다툼없는 사실, 갑 제1호증, 2호증의 1 내지 3, 4호증, 8호증의 각 기재 및 변론 전체의 취지

2. 이 사건 처분의 적법 여부

가. 원고의 주장

유aa이 2013. 7.경부터 이 사건 회사의 실질적인 대표자로서 회사 운영을 하였

고, 원고는 형식상 대표이사일 뿐이므로, 원고가 이 사건 회사의 과점주주라고 보아 내려진 이 사건 처분은 위법하다.

나. 관계 법령

별지 기재와 같다.

다. 판단

구 국세기본법 제39조 제2호에서 정한 과점주주에 해당하는지를 판단하는 데 전제

가 되는 주식의 소유사실은 과세관청이 주주명부나 주식이동상황명세서 또는 법인등기

부등본 등 자료에 의하여 이를 입증하면 되고, 다만 위 자료에 비추어 일견 주주로 보

이는 경우에도 실은 주주명의를 도용당하였거나 실질소유주의 명의가 아닌 차명으로

등재되었다는 등의 사정이 있는 경우에는 단지 그 명의만으로 주주에 해당한다고 볼

수는 없으나, 이는 주주가 아님을 주장하는 그 명의자가 입증하여야 한다(대법원 2004. 7. 9. 선고 2003두1615 판결 등).

위 법리에 비추어 이 사건을 보건대, 갑 제 4, 5호증, 을 제1, 2호증의 각 기재에

의하면, 원고는 이 사건 회사의 법인등기부등본 및 사업자등록증에 대표이사로 기재되

어 있고, 이 사건 회사의 체납세금 발생 당시 주식변동상황명세서에는 이 사건 회사의

총 발행주식 100%에 해당하는 10,000주를 보유한 주주로 기재되어 있는 사실, 원고가

2013년 이 사건 회사로부터 급여를 지급받은 사실은 인정된다.

그러나 갑 제9, 10호증의 각 기재 및 증인 김aa, 김bb의 각 증언에 변론 전체

의 취지를 더하여 인정되는 다음과 같은 사정들 즉, ① 원고는 2013. 5.경 건강상의 문제로 이 사건 회사를 퇴사한 사실, ② 이후 2013. 10. 1.부터 2014. 6. 30.까지 ‘aaa’이라는 상호의 회사 관리부에서 근무하였던 사실, ③ 유aa은 이 사건 회사가 물품거래를 하거나 대금결제, 직원 급여 지급 등 제반업무를 총괄하면서 직접 지시하였고 법인 통장도 관리하였던 사실, ④ 이 사건 회사의 직원들은 유aa을 사장으로 불렀고 임금체불되어 이후 노동부에 신고한 후 유aa으로부터 체불임금을 지급받은 사실 등

을 종합하여 보면, 원고가 이 사건 회사의 주주 명부에 주주로 등재되어 있었더라도

이는 형식상 주주라고 봄이 상당하므로, 원고가 구 국세기본법 제39조 제2호 소정의

과점주주에 해당한다고 볼 수는 없다. 따라서 이와 다른 전제에서 한 피고의 이 사건

처분은 위법하다.

3. 결론

그렇다면 원고의 이 사건 청구는 이유 있으므로 이를 인용한다.